射精几天后小便出现尿道口刺痛可能是由性交时间过长、前列腺炎、泌尿系统结石等因素引发的，具体处理方法要根据具体原因来分析。
1.性交时间过长
由于性生活时间较长，动作幅度较大，容易使尿道口被反复摩擦，导致局部软组织受到损伤，出现充血、水肿等症状，排尿时刺激到损伤部位，引起疼痛。
在性生活过程中，应控制好时间，同时将内衣裤换成纯棉材质，减少对于尿道口的摩擦。若水肿情况较为明显，可以采用冷敷的方式缓解肿痛。
2.前列腺炎
由于机体抵抗力低下，病原体侵犯前列腺，并大量繁殖，引起炎症，使前列腺充血。性生活射精时，前列腺充血现象加重，可能加重病情，后续可能影响排尿，出现上述情况。
患者应在医生的指导下，服用盐酸左氧氟沙星胶囊、氨苄西林胶囊、盐酸环丙沙星胶囊等药物进行抗菌治疗，控制炎症。患者还可选择物理热疗，利用微波、激光等手段，使前列腺组织血液循环加快，有利于消除炎症，缓解组织水肿。患者需注意清淡饮食，避免喝酒，作息规律，增强机体免疫力。
3.泌尿系统结石
若患者饮水量较少、出汗量较多，导致尿中钙和盐过于饱和，形成晶体，形成泌尿系统结石。性生活射精过程中，机体出现大幅度动作，导致结石移动，损伤尿道口，小便时尿道口受到刺激，出现刺痛、出血等表现。
可遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠胶囊、塞来昔布胶囊等药物，缓解疼痛，若结石较大，疼痛特别明显时，可以选择体外冲击波碎石手术，通过X射线定位结石，利用高能冲击波使结石粉碎，随尿液排出体外。患者要多喝水，增加排尿量，有助于微小结石的排出，注意休息，不要憋尿，避免久坐，避免结石沉积在体内。
此外，若患有膀胱肿瘤，也会出现相关症状。若症状长时间未得到缓解，建议立即就医，以防耽误疾病治疗，加重病情。
