原发性高血压需与肾实质性、肾血管性、原发性醛固酮增多症、嗜铬细胞瘤、皮质醇增多症、主动脉缩窄等继发性高血压以及其他可能导致高血压的疾病进行鉴别诊断。
1.肾实质性高血压：多种原因导致的肾实质性病变引起的高血压称为肾实质性高血压。常见的疾病有急、慢性肾小球肾炎，糖尿病肾病，慢性肾盂肾炎，多囊肾，肾移植后等。这类患者往往有蛋白尿、血尿、贫血等表现，血肌酐、尿素氮水平常升高，肾脏B超能发现肾脏结构的异常。
2.肾血管性高血压：肾动脉狭窄导致肾脏血流灌注减少，引起的高血压称为肾血管性高血压。常见的病因有大动脉炎、动脉粥样硬化、纤维肌性发育不良等。患者多有舒张压中、重度升高，上腹部或背部肋脊角处可闻及血管杂音。肾动脉造影可明确诊断。
3.原发性醛固酮增多症：由于肾上腺皮质分泌过多的醛固酮导致的高血压称为原发性醛固酮增多症。患者除了高血压，还常伴有低血钾、碱中毒、周期性瘫痪等症状。血醛固酮水平、肾素活性测定、盐水负荷试验等有助于诊断。
4.嗜铬细胞瘤：起源于肾上腺髓质、交感神经节或其他部位的嗜铬组织，间歇或持续释放大量儿茶酚胺，引起持续性或阵发性高血压和多个器官功能及代谢紊乱的疾病称为嗜铬细胞瘤。患者血压常阵发性或持续性升高，发作时常伴有头痛、心悸、多汗、面色苍白等症状。血、尿儿茶酚胺及其代谢产物测定，肾上腺B超或CT等有助于诊断。
5.皮质醇增多症：各种原因导致肾上腺分泌过多糖皮质激素（主要是皮质醇）所致的疾病称为皮质醇增多症。患者除了高血压，还常有满月脸、水牛背、向心性肥胖、皮肤紫纹、毛发增多等表现。血皮质醇节律测定、地塞米松抑制试验、小剂量地塞米松抑制试验等有助于诊断。
6.主动脉缩窄：先天性主动脉缩窄是一种较为常见的先天性心血管畸形，指发生在主动脉弓降部的局限性狭窄。患者上肢血压高于下肢血压，狭窄段上方主动脉扩张。主动脉造影可明确诊断。
7.其他：一些其他疾病也可能导致高血压，如睡眠呼吸暂停低通气综合征、甲状腺功能亢进、颅内肿瘤等。
需要注意的是，继发性高血压的病因较为明确，通过相关检查如血、尿儿茶酚胺测定、肾及肾上腺超声、CT、磁共振成像（MRI）等检查，以及结合临床症状、体征，一般不难鉴别。对于中、重度高血压患者，或降压效果不理想的患者，应及时到医院就诊，明确病因，以便进行针对性治疗。
