大便时肛门疼的原因有肛裂、外痔、肛管炎、肛窦炎、肛周脓肿、肠道疾病、肛门损伤、恶性肿瘤等，持续不缓解或伴有其他症状应及时就医。
1.肛裂
肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。
2.外痔
肛门缘皮肤皱襞突起，皮下有曲张的静脉丛，排便时或久蹲后肛门部剧烈疼痛，排便、咳嗽、喷嚏或活动时疼痛加剧。
3.肛管炎
长期的粪便刺激和不良的排便习惯等引起的肛管部位的炎症，也会导致肛门疼痛。
4.肛窦炎
通常表现为肛门部下坠感、隐痛，排便时因粪便压迫发炎的肛窦而致肛门部灼痛，若括约肌因受刺激而挛缩，疼痛则加剧，并向臀部及股后部放射。
5.肛周脓肿
肛门周围出现脓包，伴有剧烈的疼痛，排便或行走时加重，甚至会出现发热、寒战等全身症状。
6.肠道疾病
如肠炎、肠易激综合征等，也可能引起肛门疼痛。
7.肛门损伤
如肛门撕裂伤、烫伤等，会导致肛门疼痛和出血。
8.其他原因
恶性肿瘤、溃疡性结肠炎、克隆氏病等也可能引起肛门疼痛。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，大便时肛门疼还可能有其他原因。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如出血、肿块、瘙痒等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因并采取相应的治疗措施。
此外，对于一些特殊人群，如孕妇、老年人、长期便秘或腹泻患者等，大便时肛门疼更需要引起重视，及时就医，以便早期发现和治疗潜在的疾病。同时，保持良好的饮食习惯和排便习惯，多喝水、多吃膳食纤维、适量运动，有助于预防和缓解肛门疼痛的发生。
