阴茎上长小肉疙瘩可能与珍珠状阴茎丘疹、龟头炎、尖锐湿疣等原因有关，需根据具体病因进行针对性治疗，疾病详情及治疗方式如下：
1、珍珠状阴茎丘疹
珍珠状阴茎丘疹病因尚不明确，可能与生理发育变异、局部刺激等因素有关，包皮过长、个人卫生条件差、频繁手淫等因素，也可能增加患有珍珠状阴茎丘疹的风险。该病可使患者阴茎冠状沟边缘和冠状沟内，出现大小不一的珍珠状丘疹，可表现为白色、黄色、淡红色，患者肉眼看着像小肉疙瘩，通常无明显不适发生，存在炎症刺激时，可出现轻微瘙痒。
该疾病属于良性疾病，患者通常无需进行特殊治疗。日常保持会阴部清洁干燥，勤换洗内裤，避免局部过于潮湿，纠正不良的手淫习惯。患者也可结合自身需求采取物理治疗去除皮损，包括冷冻治疗、激光治疗、高频电外科疗法等。
2、龟头炎
龟头炎可能与微生物感染、尿液或碱性物质刺激、过敏反应、创伤等因素有关，环境卫生状况不佳、过度清洁、免疫功能低下等因素，也可能诱发或加重该疾病。当炎症累及患者阴茎部位时，可导致局部皮肤黏膜出现水肿、红斑、水疱等情况，类似小肉疙瘩，同时还可伴有瘙痒、疼痛等不适。
患者需保持局部清洁，避免受到外界因素刺激，以免加重病情发展。如果是厌氧菌感染引起的，可在医生指导下使用硝基咪唑类药物治疗，比如甲硝唑片、替硝唑片、奥硝唑片等。如果是白色念珠菌感染引起的，可遵医嘱局部使用抗真菌药物，比如克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏、酮康唑乳膏等。对于因包皮过长导致疾病反复发作的患者，可待炎症消退后，进行包皮环切术治疗。
3、尖锐湿疣
尖锐湿疣主要是因感染人乳头瘤病毒所引起，性伴侣过多、免疫力低下、吸烟、喝酒等因素，也可能容易患有尖锐湿疣。男性患有尖锐湿疣后，可使龟头、冠状沟、包皮系带、阴茎等部位出现单个或多个淡红色小颗粒，随着病情进展，可逐渐增多增大，形成乳头状、菜花状，并可伴有局部糜烂、渗液、出血等表现。
患者可在医生指导下局部用药治疗消除皮损，比如鬼臼毒素软膏、咪喹莫特乳膏、三氯乙酸溶液等，也可采取物理治疗，比如冷冻治疗、激光治疗、电离子治疗、微波治疗等，直接作用于皮损部位，使其坏死脱落，从而达到治疗目的。对于保守治疗不佳或皮损范围较大的患者，可考虑进行手术切除治疗。
除了上述比较常见的原因外，生殖器疱疹、梅毒、艾滋病等疾病也可以导致此症状。若患者局部瘙痒、疼痛、渗液等情况比较严重，建议及时前往医院完善相关检查，明确具体原因，以便于对因治疗，多数能够得到有效缓解，建议患者避免过于紧张。
