右侧肩膀一深呼吸就疼的原因可能与软组织损伤、胸膜炎、骨折等有关，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等方法进行治疗。
1、软组织损伤
姿势不正确、肩关节过度使用等，可能会导致软组织损伤，出现深呼吸时，右侧肩膀疼痛。
这种情况下，建议患者多休息，避免活动肩部，以促进软组织修复。通过局部热敷、冷敷等，能够帮助缓解疼痛。在医生指导下使用布洛芬、双氯芬酸钠、对乙酰氨基酚等药物，能够起到消炎、止痛作用。
2、胸膜炎
胸膜炎会导致胸膜充血，深呼吸时的肺部扩张过程中可能会摩擦胸膜，导致疼痛产生，这种疼痛可能会随着神经传导，放射到右侧肩膀区域。
患者应注意多休息，避免剧烈运动，防止影响病情恢复。如果是细菌感染引起的胸膜炎，可以遵医嘱使用阿莫西林、左氧氟沙星、阿奇霉素等药物进行抗感染处理。胸膜炎出现肺不张或者胸廓塌陷时，应及时进行外科手术治疗，控制病情。
3、骨折
肩关节存在骨折时，深呼吸可能会牵拉到受损组织，导致患者产生疼痛不适。
骨折没有出现明显移位时，可以通过三角巾固定的方式，促进骨折断端稳定修复。在医生的指导下使用塞来昔布、吲哚美辛、对乙酰氨基酚等药物，可以达到止痛目的。骨折出现明显移位时，患者需要及时进行手术治疗将骨折断端复位，同时对骨折进行内固定。
