肛门痒痒可能与不良卫生习惯、过敏反应、肛门直肠疾病等因素有关，可以根据病因采取日常生活管理、药物治疗、手术治疗等治疗措施。
如果平时不注意肛门部位的清洁卫生，如大小便后没有擦拭干净，残留物可能会刺激肛门周围皮肤，从而引起肛门瘙痒症状，一般不需要特殊治疗，平时多注意个人卫生，每天用温水清洗局部，保持局部的清洁卫生，有助于缓解不适。
如果本身属于过敏体质，当进食某些易过敏的食物，如鱼肉、鸡蛋等，或者穿着的内裤中含有某些致敏物质，便会引发过敏反应，导致体内产生过多组胺，并作用于神经末梢，从而产生瘙痒感。建议患者及时明确过敏原，避免与过敏原接触，有助于减轻瘙痒症状。若瘙痒症状较为严重，可以遵医嘱使用氯雷他定、西替利嗪、地氯雷他定等抗组胺药物，通过选择性地拮抗外周组胺H1受体，从而达到抗过敏作用。
如果患有痔疮、肛裂、肛瘘、直肠脱垂等疾病，这类疾病会导致肛门分泌物增多，进而刺激肛周皮肤产生瘙痒感。建议患者及时明确病因，然后进行对因治疗，如直肠脱垂引起的症状，可以先尝试进行手法复位，若无法手法复位，脱垂严重，建议及时考虑手术治疗，常用手术方式有直肠悬吊固定术、经会阴直肠乙状结肠切除术等，通过切除脱垂的直肠，减少局部分泌物渗出，从而缓解瘙痒症状。
