月经干净后三天又来可能是排卵期出血、功能性子宫出血、子宫肌瘤、子宫内膜异位症等原因引起，也可能是节育环导致，还可能是先兆流产、宫外孕等疾病导致，需要及时就医，明确原因并治疗。
月经干净后三天又来，可能是以下原因引起：
1.排卵期出血：两次月经中间，即排卵期，由于雌激素水平短暂下降，使子宫内膜失去激素的支持而出现部分子宫内膜脱落引起有规律性的阴道出血，称为排卵期出血。量一般不多，持续半天或几天，可伴有轻微腹痛或腰酸。
2.功能性子宫出血：简称功血，是一种常见的妇科疾病，是指异常的子宫出血，经诊查后未发现有全身及生殖器官器质性病变，而是由于神经内分泌系统功能失调所致。
3.子宫肌瘤：尤其是子宫黏膜下肌瘤，可因子宫腔面积扩大，于是收缩异常，导致月经过多和经期过长。
4.子宫内膜异位症：常因影响子宫肌层收缩或因内膜增强而导致月经过多或经期延长。
5.其他：如放置节育环，也可能会导致月经干净后又来。
如果出现月经干净后三天又来的情况，需要引起重视，及时到医院进行检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，需要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。
此外，对于青春期少女和更年期妇女，如果出现月经异常，应及时就医，排除器质性病变。对于有性生活的女性，月经干净后又来还应排除怀孕相关疾病，如先兆流产、宫外孕等。
总之，月经干净后三天又来是一种异常现象，需要引起重视，及时就医，以便明确原因，进行针对性治疗。
