皮下有黑点长在肉里考虑与色素痣、跖疣、紫癜等原因有关，处理措施需要根据病因决定，具体如下：
1、色素痣
黑色素细胞良性增生时会形成色素痣，一般界限清晰、边缘规则、色泽均匀，有些色素痣呈黑色，因此会出现皮下有黑点长在肉里的情况。
色素痣一般不需要进行特殊治疗，若色素痣迅速增大、局部有刺痒、疼痛感时，则考虑有恶变倾向，可通过激光、冷冻或是手术切除方式去除。
2、跖疣
若是足底部出现皮下有黑点，呈一个或数个则考虑是跖疣。跖疣是感染人乳头瘤病毒引起的，皮损部位为圆形乳头状角质增生，由于跖疣会在皮肤深层与血管连接，因此外观上会有黑色淤血点出现。
患者可外用水杨酸、斑蝥素祛除疣体表面角质，外用5%氟尿嘧啶软膏、5%咪喹莫特乳膏，促进表皮脱落进行治疗。还可通过皮内注射博来霉素、平阳霉素、干扰素等药物祛除疣体。平时应保持患处清洁，避免摩擦。
3、紫癜
紫癜是指皮肤、黏膜下小的出血点，一般压之不褪色，是出血性疾病，常见过敏性紫癜、血管内压力增多性紫癜等。患者会有针尖大小、群集或散在的瘀点、瘀斑，大多无症状，属于自限性疾病。
患者发病期间避免过度劳累。若是过敏性紫癜，应减少易致敏食物的摄入，患者可服用非甾体抗炎药缓解腹痛、关节痛的症状，如布洛芬、对乙酰氨基酚等；血管内压力增多性紫癜不需特殊治疗，若患者有剧烈咳嗽的症状，可使用右美沙芬、喷托维林等药物镇咳。
