孩子睡着咳嗽厉害、有痰可能是由于上呼吸道感染、支气管炎、胃食管反流病等原因引起，可根据情况进行处理，具体如下：
病原体感染上呼吸道，引起鼻腔、咽、喉等部位的急性炎症，咽部扁桃体充血、肿大，表面有脓性分泌物，可出现咳嗽、咳痰等症状。
患儿咳嗽厉害且咳痰可遵医嘱使用镇咳祛痰药物，如可待因、右美沙芬、氨溴索、溴已新等，降低分泌物的粘稠度，增加气道纤毛清除能力，从而改善咳嗽、咳痰的症状。
病原体感染、季节变化、不良刺激等原因导致支气管粘膜和周围组织损伤引起炎症，支气管粘膜下腺体肥大，黏膜发生充血、水肿，分泌炎性渗出物形成黏液并刺激呼吸道，从而会引起患儿睡着时咳嗽厉害且有痰的情况。
对于咳嗽咳痰较厉害的患儿需使用抗菌药物，如诺氟沙星、环丙沙星等控制感染，痰液不易咳出者可使用如喷托维林、盐酸氨溴素等药物。
食管抗反流结构和功能受损以及食管清除作用降低等会导致胃内容物反流至食管，食物刺激咽喉部及气管时会影响慢性咳嗽和分泌物增多，从而导致患儿睡着后咳嗽厉害并且有痰。
遵医嘱使用奥美拉唑、兰索拉唑等抗酸药物，多潘立酮、莫沙必利等促动力药物来缓解症状。
若患者不愿服药或者合并食管裂孔疝，可采取腹腔镜下胃底折叠术以及内镜下抗反流术来治疗。
