宝宝咳嗽、反复发烧需要根据病因治疗，例如上呼吸道感染、小儿支原体肺炎、肺结核等，具体如下：
1、上呼吸道感染
宝宝鼻腔、咽部、喉部等部位感染病毒、细菌等病原体后，容易出现上呼吸道感染的情况，可表现为咳嗽、反复发烧等。
家长可以在医生指导下给宝宝使用小儿止咳糖浆、小儿咳喘灵颗粒等药物进行治疗，缓解咳嗽症状。若发烧时体温超过38.5度，通常需要给予布洛芬、对乙酰氨基酚等药物进行治疗。病毒感染存在自限性，一般无需针对性使用抗病毒药物进行干预。若存在感染细菌，可使用青霉素、阿莫西林等药物治疗。家长可适当增加宝宝的饮水量，并且经常开窗通风。本病通常预后良好，大概1-2周就会痊愈，家长无需过度担心。
2、小儿支原体肺炎
宝宝免疫力较差，感染支原体后可出现小儿支原体肺炎，从而会出现咳嗽、反复发烧等症状。
小儿支原体肺炎通常需要使用阿奇霉素、红霉素等药物进行治疗，病情较为严重的宝宝可以使用泼尼松、甲泼尼龙等糖皮质激素类药物进行治疗。通常疾病好转后，症状可逐渐消失。家长应给宝宝进食清淡易消化且富含营养的食物，提高宝宝免疫力。多数宝宝经过上述处理后预后良好，一般不会出现后遗症。
3、肺结核
如果宝宝感染结核分枝杆菌，可引起肺结核，进而会出现咳嗽且反复发烧的现象。
家长可以遵医嘱给宝宝使用异烟肼、利福平等抗结核药物进行治疗，消灭结核分枝杆菌。如果患儿病情严重，出现结核性脓胸的现象，需考虑进行手术干预。一般病情得到控制后，临床症状也会逐渐减轻、消失。宝宝出现肺结核后需要积极治疗，防止结核分枝杆菌侵犯其他器官，对身体健康造成严重影响。
