身体真菌可通过药物治疗、手术治疗以及日常生活管理等方式来清除。
1、药物治疗
由于真菌的种类和患者自身病情情况不同，需要在医生指导下合理选择不同的药物。深部真菌引起的系统性感染，如孢子丝菌病、皮炎芽生菌病等，可以遵医嘱使用伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等治疗真菌感染;浅部皮肤真菌病，如手足癣、体癣、甲癣等可以使用伊曲康唑分散片、盐酸特比萘芬片等，进行抗真菌感染治疗;真菌性肉芽肿以及孢子丝菌病患者在遵医嘱使用氟胞嘧啶片、氟康唑片等抗真菌药的同时，再使用碘化钾片，帮助提高免疫力。
2、手术治疗
手术治疗主要适用于肺真菌病、脑真菌性肉芽肿等，肺真菌病患者如果药物治疗无效、局部形成脓肿或者真菌感染形成局限性病变时，可以通过脓肿切开引流术，缓解感染的症状。如果患者出现大咯血的症状，可以考虑肺切除术，切除局部病变的组织。脑真菌性肉芽肿主要以手术治疗为主，通过开颅手术切除病灶，防止中枢神经系统出现后遗症，术后遵医嘱服用药物，如氟胞嘧啶片、硝酸咪康唑胶囊等，抑制真菌感染。
3、日常生活管理
真菌感染的患者平时注意养成良好的饮食习惯，多吃富含优质蛋白质、容易消化的食物，如牛乳、瘦肉、鸡蛋等，也可以多吃富含维生素的新鲜水果和蔬菜，如橙子、苹果、西红柿、苦瓜等，帮助增强营养，提高免疫力。平时注意清洁卫生，经常用温水淋浴，不要使用刺激性较强的硫磺皂，水温不要太高，避免乱用他人衣物、毛巾等，不去公共浴室，以免交叉感染。还应多休息，保证充足睡眠，适当增加体育锻炼，增强体质。
