低危阳性44在临床上是指低危型HPV44阳性，其可引起寻常疣、扁平疣、尖锐湿疣等疾病，治疗的方式存在一定的差别。
其可在没有治疗的情况下，自然消退，有时无需治疗。但若是疼痛较为明显、疣体扩大，影响美观时，应及时就医。在医生的建议下进行物理治疗，如电灼治疗，可根据疣体的具体情况进行烧灼、切割和汽化等；激光治疗，使用激光烧灼疣体，使其脱落，但可能会留下疤痕；还可通过温热疗法治疗，建议每次治疗持续约半小时；在医生的指导下给予药物治疗，比如5%~20%浓度的水杨酸、维A酸乳膏等药膏局部外涂；还可在医生的操作下使用注射用盐酸博来霉素、重组人干扰素α2b等药物进行皮损内注射治疗；若是皮损数目较少，则可选择刮除术治疗；还可给予中药治疗，如使用平肝活血方、治疣汤、马齿苋合剂等。
2.扁平疣
日常生活中，患者需注意个人卫生，接触皮损后应立即洗手，以防传染，保持室内环境整洁，同时需经常通风，呼吸新鲜空气。此外，遵医嘱配合医生治疗，治疗的疗程要足够，除手术以外的治疗，其他治疗方法应至少持续2~3个月。
尖锐湿疣的患者应在医生的指导下给予10%赛儿茶素软膏、鬼臼毒素软膏、胸腺肽肠溶片等药物治疗；还可以进行物理治疗，如冷冻治疗、电离子治疗、微波治疗等；若是尖锐湿疣分布广泛、药物以及冷冻等治疗无法去除皮损，则应进行手术治疗。日常生活患者应告知性伴侣自身患有尖锐湿疣，避免非婚性行为，患者在尖锐湿疣治疗最初3个月，可每2周复诊1次，3个月后，可根据自身情况，适当延长复诊的间隔期，一直到末次治疗后6个月左右。
