月经一直不干净有褐色分泌物可能是子宫内膜炎、子宫肌瘤、子宫腺肌症、宫颈息肉等疾病引起的。
患有子宫内膜炎时，由于子宫内膜充血水肿，从而可能导致月经一直不干净且分泌物呈褐色。顺产后、剖宫产或者流产手术后，由于子宫内膜受损，病原体进入创面感染，比如需氧菌、淋病奈瑟菌等，可能导致本病的发生。有多个性伴侣、性交过于频繁等也可能诱发本病。患有沙眼衣原体宫颈炎、细菌性阴道炎等疾病，也可能增加患病的风险。
患有子宫肌瘤患者，当肌瘤的体积增大，数量增多时，可能会出现月经周期延长、月经量多且伴褐色分泌物。子宫肌瘤可能与遗传、性激素水平异常等方面有关。存在肥胖、月经初潮年龄较早、多囊卵巢综合征等因素时，也可能诱发子宫肌瘤。
剖宫产、人工流产等经宫腔的操作或者手术，可能会使子宫内膜侵入子宫肌层，从而导致子宫腺肌症。患有慢性子宫内膜炎、高雌激素血症等疾病，也可能诱发本病。患有子宫腺肌症时，由于子宫内膜腺体忌间质侵入子宫肌层，从而可能出现月经一直不干净且有褐色分泌物的现象。
患有宫颈息肉时，宫颈组织增生导致局部的赘生物，当赘生物增大时，可能会导致月经失调，出现月经一直不干净并有褐色分泌物的现象。宫颈息肉可能与慢性炎症、宫颈感染等因素有关，还可能与宫颈附近出现血管阻塞、机体对雌激素水平升高产生异常反应等方面有关。女性年龄超过四十岁或者分娩次数多也可能增加患病的风险。
