如果脑炎表现出神经细胞大面积的损伤和水肿，病人可能表现出昏迷，就是意识障碍。如果大量的脑细胞因为损伤之后表现出水肿，可能表现出脑疝的风险，比如颞叶钩回疝，可以表现为一侧瞳孔散大造成瞳孔不等大、对光反射消失等。如果整个大脑弥漫性水肿可能会造成枕骨大孔疝。这些就是神经科比较危急、严重的症状。脑疝的发生有时候会影响人的呼吸和心跳中枢造成猝死，这是最严重的情况。其次，因为脑炎会使脑实质受累，因此病人可能表现出严重的癫痫持续状态，就是脑子持续放电，也会造成大脑不可逆的损伤。癫痫以及全脑的弥漫水肿是脑炎比较严重的症状。此外，可能还会有轻度的神经系统受累症状，比如记忆力障碍、情绪的改变、行为的异常等也是脑炎多见的神经系统表现。总体来说，脑炎比较严重的情况是脑子弥漫性水肿造成脑疝可能会影响呼吸、心跳造成猝死。对于单疱脑炎，如果造成持续的癫痫或癫痫持续状态，病人也可能表现出长时间的昏迷，就算昏迷醒来以后也会造成认知的障碍。因为脑子长时间缺氧以后还会表现出智力的低下。因此，癫痫、脑子的水肿、脑疝的发生属于脑炎里比较严重的并发症。
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