月经期头疼可能是由于生理现象、药物作用、环境因素、生活方式不当等非疾病因素，或是上呼吸道感染、神经官能症、脑炎等疾病因素导致的，需要进行针对性的治疗。
1、生理现象
这是正常的生理现象，疼痛感一般不会过于强烈，月经结束后就可自行缓解。如果疼痛严重，可给予布洛芬缓释片、对乙酰氨基酚片、布洛芬胶囊等药物止痛。
月经期女性不规范使用盐酸吗啡片、硫酸吗啡缓释片、盐酸羟考酮缓释片等药物，可能会影响中枢神经功能，进而出现月经期头疼的现象。
3、环境因素
这是常见的生理现象，进行局部热敷，做好头部保暖，一般很快就可以自行缓解。
情绪过于紧张焦虑、过度疲劳、长期熬夜等都可能会引起女性内分泌功能失调，影响激素分泌，进而在月经期出现头疼、腹痛等不适症状。
二、疾病因素
女性在月经期免疫力会下降，外界病原体就会侵袭上呼吸道黏膜引起感染。常见的致病菌一般是病毒，病毒在体内快速复制代谢，生成的毒性代谢废物可随血液循环，引起头疼、全身酸痛等不适症状。
2、神经官能症
首先要养成良好的生活规律，可进行专业的心理治疗改善情绪。如果症状严重，可使用抗焦虑药物、抗抑郁药、受体阻断剂等进行治疗。如果药物和心理治疗无效，可考虑行电抽搐治疗，对于强迫伴抑郁症状的患者有较好的效果。
月经期女性免疫力较差，更容易被病原体感染引起脑炎。脑内组织受到炎症刺激，可出现头疼、身痛、恶心、乏力等症状，还可能引起昏迷。
脑炎患者要及时使用药物控制炎症，比如单纯疱疹病毒感染者可用阿昔洛韦片治疗，巨细胞病毒感染者可用更昔洛韦胶囊，细菌感染可用头孢克肟胶囊，真菌感染者可用伊曲康唑分散片治疗。平时接种疫苗、积极锻炼，有助于预防脑炎。
