抗甲状腺微粒体抗体如果测定明显增高，临床医生会告诉病人得了桥本甲状腺炎。桥本甲状腺炎是一种自身免疫性的甲状腺炎，是自己的免疫系统在保护甲状腺的时候，把甲状腺的自身成分，甲状腺微粒体认为是敌人，敌我不分产生甲状腺微粒体抗体，抗体本身并不会直接破坏甲状腺。但是如果体内甲状腺微粒体抗体增高，说明体内存在着自身免疫性的炎症。经过显微镜会发现，甲状腺里面滤泡细胞被破坏，有大量的淋巴细胞浸润，时间长了甲状腺功能受到影响，甲状腺工厂就会减少生产甲状腺激素水平。经过测定甲状腺微粒体抗体和甲状腺球蛋白抗体，有助于诊断桥本甲状腺炎。桥本甲状腺炎，如果甲状腺功能正常，没有甲亢或甲减，医生会嘱咐不需要特别的治疗。在饮食上也不需要吃所谓补碘的盐，海产品也可以正常地食用，要求定期复查甲状腺功能。因为桥本甲状腺炎，以后发生甲减的机会会明显增多。微粒体抗体增高，又存在着甲减，医生会建议使用左甲状腺激素替代治疗。使用左甲状腺激素替代治疗，并不是针对甲状腺微粒体抗体增高。实际上千万防止用各种所谓的中药，来降低甲状腺微粒体抗体。因为有研究发现，没有有效的药物降低抗体，而且降低以后对身体没有任何的益处。
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