打完疫苗胳膊酸疼的原因为针头刺激、疫苗对周围组织的刺激、疫苗未被完全吸收、注射方法不当以及过敏反应或自身免疫系统反应。
1.针头刺激
在接种疫苗时，如果接种者不够放松，注射时肌肉处于紧绷状态，或者是针头刺激到了胳膊上的末梢神经，都可能导致胳膊酸疼，这种情况一般会在1-3天内自行缓解。
2.疫苗对周围组织的刺激
疫苗中除了抗原蛋白外，还含有一些佐剂，全病毒灭活疫苗还含有已灭活的核酸、糖蛋白、磷脂等多种成分。这些成分可能会对神经或肌肉产生刺激，导致胳膊酸疼。有时可能会伴随注射部位红肿、皮温升高、食欲不振、低热等不良反应，但通常一周内都会自行缓解或消失。
3.疫苗未被完全吸收
注射时精神紧张或是疫苗注射后进行重体力劳动等，会使肌肉绷紧，从而影响疫苗的吸收效率。疫苗在人体内未被完全吸收时，可能会导致局部产生硬结、红肿或是导致胳膊酸疼。因此，接种后应避免揉搓针孔，保持肌肉放松，避免重体力劳动。
4.注射方法不当
有可能在注射时，进针比较深而导致局部疼痛，这种情况下的疼痛通常会在短时间内得到缓解。
5.过敏反应或自身免疫系统反应
人体接触疫苗成分后，会快速启动免疫系统，多种免疫因子聚集在注射部位形成保护屏障。这个过程可以增加局部的代谢，激活局部组织发生超敏反应，受种者可能会感觉到手臂疼痛、酸胀。这属于常见的不良反应，一般能自行缓解，不需要特殊处理。
