怀孕初期流褐色分泌物可能是先兆流产、异位妊娠、妇科炎症等引起的，需要根据具体的原因进行正确干预治疗。
先兆流产与胚胎染色体异常、妊娠期间母体遭受严重感染、创伤、生殖器官畸形、内分泌异常、精子质量低下等因素有关。一般发生先兆流产，患者会先出现阴道出血现象，一般量少，色暗红，随后伴随腹痛现象。所以患者怀孕初期流褐色分泌物可能是先兆流产的表现。需要立即去医院就诊，积极遵医嘱使用微粒化黄体酮或黄体酮阴道缓释凝胶进行保胎治疗。如果流产已经不可避免，则需要尽早行清宫术治疗。
异位妊娠一般与输卵管炎症、发育不良、输卵管手术史、周围组织占位性病变、避孕失败等因素有关。异位妊娠多数发生在输卵管部位，当胚胎增大导致输卵管破裂时，患者会有阴道出血、腹痛等现象，所以可导致怀孕初期流褐色分泌物。明确异位妊娠且输卵管已经破裂时，应该尽早行输卵管除术或者保守性手术治疗。
如果存在阴道炎、宫颈炎等妇科炎症，患者的阴道、宫颈等部位受到炎症刺激而出现黏膜损伤现象，也可能会导致出血，产生褐色分泌物。此时需要明确感染的病原体类型，选择合适的药物控制炎症。比如细菌性阴道炎可以选择克林霉素磷酸酯片、甲硝唑片、替硝唑片治疗。滴虫性阴道炎可以选择甲硝唑片、替硝唑片治疗。外阴假丝酵母菌病可以选择克霉唑阴道片、硝酸咪康唑栓、制霉菌素片等药物治疗。淋病奈瑟菌感染引起的宫颈炎可以使用头孢菌素类、头霉素类、氨基糖苷类抗生素治疗。沙眼衣原体感染引起的宫颈炎可以使用四环素类、大环内酯类、氟喹诺酮类药物治疗。
