两岁宝宝反复发烧最常见的原因是感染性发烧，以病毒感染、细菌感染多见，也不排除支原体等其他微生物感染引起。其次是非感染性因素引起的，比如自身免疫性疾病和内分泌性疾病，需要根据病因进行针对性治疗，具体如下：
1、感染性发烧
由于宝宝免疫力比较差，容易发生细菌、病毒等感染，引发呼吸道、消化道、泌尿道等感染，导致宝宝反复发烧。呼吸道感染由病菌侵袭气道和肺部感染引起，主要病菌包括肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、副流感病毒、流感病毒引起。消化道可因为细菌或病毒感染引起急性胃肠炎引起发热，泌尿系统由细菌、支原体等引起尿路感染可导致发烧。小儿由于免疫力较差等原因，容易发生病情加重、反复发烧的情况。
针对两岁宝宝反复发烧，在对症应用退烧药物，如对乙酰氨基酚、布洛芬缓解发热的同时，还需要积极寻找病因进行治疗。细菌感染选用青霉素、头孢等抗生素;支原体感染选用红霉素、阿奇霉素等大环内酯类抗生素;流感病毒感染及时应用磷酸奥司他韦等药物;小儿反复发烧还可以选用一些清热凉血的中药制剂。
2、非感染性发烧
自身免疫性疾病有小儿类风湿病，如幼年型类风湿关节炎，是小儿时期一种常见的结缔组织病，患儿往往先有持续性不规则发烧。治疗主要用非甾体类抗炎药，首选阿司匹林，若治疗无效或不能耐受则换用其他非类固醇抗炎药，此类药物使用疗程长，症状控制后仍须维持至少半年。
内分泌疾病如甲亢，一般由于甲状腺激素产生过多所致。甲状腺激素可使机体新陈代谢增强，故会引起人体出现发热、消瘦、情绪激动、心动过速等症状。甲亢患者在治疗上首先需要控制甲状腺激素水平，待其达到正常水平，发热症状便可缓解。临床上药物包括甲巯咪唑片、左甲状腺素钠片、丙硫氧嘧啶片等，甲亢患者需要通过长期用药，使激素水平处于稳定状态，反复发热症状通常可以消除。 如果两岁宝宝反复发烧三天以上、高烧不退或精神差等需带宝宝及时就医明确病因，对症治疗。
