核酸检测阴性但是咳嗽不止，可能是由是由上呼吸道感染、支气管炎、过敏性咳嗽、尘肺病等情况导致的，需要根据具体情况进行治疗。
上呼吸道感染是由感染副流感病毒、腺病毒、鼻病毒、柯萨奇病毒等病毒和肺炎链球菌、葡萄球菌、革兰氏阴性杆菌等细菌导致的，这些病原体会损伤鼻咽喉部位黏膜，引起炎症反应，炎症时分泌炎性分泌物需要通过咳嗽、咳痰等方式排出体外，所以患上上呼吸道感染会导致患者出现核酸检测阴性，但咳嗽不止的症状。
2.支气管炎
支气管炎患者需要遵医嘱进行对症治疗，咳嗽无痰或是少痰症状的患者，可以使用右美沙芬片、喷托维林片等止咳药缓解咳嗽症状；痰量较多患者可以使用盐酸氨溴索片、乙酰半胱氨酸片等药物进行祛痰治疗。
过敏性咳嗽发病原因尚不明确，长时间讲话、油烟、香烟烟雾、灰尘、冷空气等因素会诱发过敏性咳嗽，过敏性咳嗽患者主要症状为长期刺激性干咳，所以核酸检测阴性但咳嗽不止，可能是由过敏性咳嗽导致的。
4.尘肺病
尘肺病患者需要脱离粉尘作业，需要医生根据其具体症状予以相应药物治疗，伴有喘息、气促等症状的患者，需要给予沙丁胺醇片、特布他林片等药物缓解症状；咳嗽症状严重的患者，需要给予右美沙芬片、福尔可定片等止咳药进行治疗；痰多患者可以给予乙酰半胱氨酸片、盐酸氨溴索片等药物进行祛痰治疗；使用吡非尼酮片、尼达尼布片等药物可以预防肺纤维化。终末期尘肺病患者也可以通过肺移植进行治疗。
