蝼蛄不去内脏通常可以吃。因为蝼蛄的内脏具有药效，将内脏去除后可降低药用价值。
中医认为蝼蛄性寒，具有利水消肿、通淋的功效，常用于治疗水肿证、淋证等。蝼蛄的内脏与其整个身体一样具有药效，因此，在药用时，一般不会去除内脏。去除内脏会导致蝼蛄的药用效果下降，起不到应有的治疗效果。
虽然蝼蛄内脏具有药用价值，但在食用前，仍需进行适当的处理。捕捉回来的蝼蛄首先需要用开水烫死，以去除其活动能力。然后，可以选择去除头、肢体、翅膀，但内脏通常不去除。为清洁蝼蛄体内的泥土和杂质，可以用20%比例的淡盐水浸泡一两个小时，这样蝼蛄会吐出肚子里的脏东西，同时淡盐水还能杀菌消毒。
虽然蝼蛄对人体有很多好处，但是不宜一次性吃过多，每次吃2-3个即可，否则会损伤脾胃阳气，引起胃痛、畏寒怕冷等脾胃虚寒症状。由于蝼蛄引导体内的气血、津液等向下流动，以及通便利尿、活血化瘀、行气止痛等功效较强，所以气虚体弱者及孕妇忌用，以免导致病情进一步加重或者诱发流产。建议将蝼蛄用药或食用前，先到医院咨询医生，避免引起不必要的不良反应。
