胃蛋白酶偏低可能与植物神经功能失调、萎缩性胃炎、胃溃疡等因素有关，应根据病因对症治疗。
1、植物神经功能失调
人体长时间处于压力过大、失眠、焦虑状态下，可引起植物神经功能失调，当影响胃肠神经时，可导致胃酸分泌减少，从而引起胃蛋白酶偏低的情况。
患者可通过适当运动，调节情绪等缓解植物神经功能失调的情况；当症状严重时可使用谷维素、维生素B1等药物营养神经，调节神经功能；平常应注意培养良好的生活习惯，规律作息。
2、萎缩性胃炎
萎缩性胃炎通常是由于胃部感染幽门螺杆菌后引起胃黏膜损伤、萎缩所致，会导致胃底和胃体粘膜上的细胞产生的胃蛋白酶原减少。
萎缩性胃炎患者可使用奥美拉唑、兰索拉唑等抑酸药物+克林霉素、阿莫西林、替硝唑、甲硝唑等抗生素药物+枸橼酸泌钾、果胶秘等药物根除幽门螺杆菌。日常应确保营养均衡，不要抽烟喝酒，规律作息，避免食用辛辣刺激性食物。
3、胃溃疡
由于饮食刺激或细菌感染导致胃黏膜损伤形成溃疡，而胃底和胃体粘膜上的细胞损伤可减少胃蛋白酶原分泌，从而导致胃蛋白酶降低。
患者可使用雷贝拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑等药物抑制胃酸分泌；使用硫糖铝、铝碳酸镁等药物保护胃黏膜。对于难治性、复发性溃疡或者有恶变几率的溃疡可以考虑手术治疗。
