三岁宝宝夜里莫名哭闹通常是因为环境因素所致，但也有可能是由于消化不良、上呼吸道感染等疾病因素导致的，需要根据病因对症处理，具体如下：
1、环境因素
如果宝宝在睡眠时外界环境过于吵闹、炎热、寒冷等，会影响宝宝的睡眠状态，导致宝宝在睡眠中惊醒，从而引发宝宝哭闹。
在宝宝睡眠时应该注意睡眠环境不能太过嘈杂，尽量让宝宝感觉温暖舒服；平时可以让宝宝适量吃含钙量多的食物，例如紫菜、海带等，也可以通过多晒太阳促进钙的吸收，增强宝宝抵抗力。
2、消化不良
由于宝宝的消化系统还没有完善，消化功能不足，如果喂食过多难以消化的食物可能会导致宝宝出现腹胀、腹泻、呕吐等症状，进而引发宝宝夜间哭闹。
宝宝出现消化不良症状时，家长应注意宝宝的饮食状况，不能喂生冷、辛辣、刺激类食品，适量吃易于消化的水果、蔬菜，例如西红柿、香蕉、苹果等。
如果宝宝出现严重的消化不良，可以遵医嘱服用小儿健胃消食片、肥儿丸等药物促进消化。
3、上呼吸道感染
上呼吸道感染通常是由于病毒感染所导致，宝宝会出现发热、咳嗽、畏寒、流涕、寒战等不舒服的症状，从而引发宝宝夜间哭闹。
宝宝出现上呼吸道感染的病症时，家长应注意宝宝的保暖情况，给宝宝多饮热水，适当补充含有丰富的蛋白质及维生素的食物。
必要时可以给宝宝服用药物缓解症状，如小儿氨酚黄那敏颗粒、小柴胡冲剂等。如果出现高热的症状，应使用非甾体类抗炎药，例如对乙酰氨基酚、布洛芬胶囊等。
