胎停育的原因复杂，包括染色体异常、内分泌失调、免疫因素、子宫异常、环境因素和男方因素等。
1.染色体异常
染色体异常是胎停育常见的原因之一。无论是精子还是卵子，只要携带基因遗传物质的染色体发生了异常，即使形成了受精卵，胚胎也不会正常发育。
2.内分泌失调
胚胎着床及继续发育依赖于复杂的内分泌系统彼此协调，任何一个环节失常，都可致流产。胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是人绒毛膜促性腺激素，作为母体来讲，自身的内源性激素不足，就满足不了胚胎的需要，就有可能造成胚胎的停育和流产。
3.免疫因素
妊娠宫内的胚胎或胎儿实属同种异体移植，因为胎儿是父母的遗传物质的结合体和母体不可能完全相同。母一胎间的免疫不适应而引起母体对胎儿的排斥。常见的自身免疫疾病为系统性红斑狼疮、硬皮病、混合性结缔组织病、皮肌炎等。其二是生殖免疫的问题，如果自身带某种抗体，就有可能影响胚胎的发育。
4.子宫异常
子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响。内环境就是子宫内膜，如果太薄、太厚都会影响着床。由于子宫缺陷引起的胎停育约占10%~15%，主要包括子宫纵隔、子宫发育不良、子宫肌瘤和子宫内膜息肉等。
5.环境因素
妊娠期生理状态的改变、使母体对治疗药物和环境毒素的吸收、分布和排泄发生了较大的改变，在发育初期，胚胎对治疗药物和环境因素的影响极为敏感，此时各种有害因素都可导致胚胎的损伤、甚至丢失。
6.男方因素
胚胎停育的原因也可能是男方的因素。有关研究显示，在胎停育患者中，大约有60%的男性精液中存在着精子DNA碎片，过多精子DNA碎片会影响精卵结合、受精卵的着床及胚胎发育。
需要注意的是，以上只是一些常见的胎停育原因，实际上还有很多其他因素可能导致胎停育。如果发生胎停育，夫妻双方应该及时就医，进行全面的检查和诊断，以确定具体的原因，并采取相应的治疗措施。
