治疗甲状腺疾病的药物主要有以下几类：
1.甲状腺激素制剂：
左甲状腺素钠：为人工合成的四碘甲状腺原氨酸钠，适用于先天性甲状腺功能减退症与儿童及成人的各种原因引起的甲状腺功能减退症的长期替代治疗，也可用于单纯性甲状腺肿，预防甲状腺肿复发，抗甲状腺药物冶疗甲状腺功能亢进症的辅助治疗，甲状腺癌术后的抑制治疗。
甲状腺片：由猪、牛、羊等食用动物的甲状腺体制成，主要用于各种原因引起的甲状腺功能减退症的替代治疗。
2.抗甲状腺药物：
丙硫氧嘧啶：适用于各种类型的甲状腺功能亢进症，尤其适用于病情较轻，甲状腺轻至中度肿大患者；青少年及儿童、老年患者；甲状腺手术后复发，又不适于放射性[碘-131]治疗者；手术前准备；作为碘-131放疗的辅助治疗。
甲巯咪唑：适用于各种类型的甲状腺功能亢进症，尤其适用于病情较轻，甲状腺轻至中度肿大患者；青少年及儿童、老年患者；甲状腺手术后复发，又不适于放射性[碘-131]治疗者；手术前准备；作为碘-131放疗的辅助治疗。
3.碘和碘化物：
碘化钾：可单独用于治疗地方性甲状腺肿，由于摄入量不易掌握，现已很少单独使用。
复方碘溶液：仅用于手术前准备和甲状腺危象。
4.β肾上腺素能受体阻滞剂：
普萘洛尔：适用于控制甲亢症状，适用于基础代谢率较高的Graves甲亢病人及甲状腺危象。
需要注意的是，药物治疗甲状腺疾病应在医生的指导下进行，剂量应根据患者的具体情况进行调整。同时，治疗期间应定期复查甲状腺功能，以便及时调整治疗方案。此外，对于孕妇、哺乳期妇女、儿童、老年人等特殊人群，使用药物时应更加谨慎，需遵医嘱。
