小便完后刺痛可能是因为尿道炎、尿道结石、尿道肉阜等引起的，需要针对具体的病因进行治疗。
尿道炎与淋球菌、非淋球菌感染相关，不注意个人卫生、不洁性行为、饮水少、过度劳累、饮食辛辣等都可以诱发尿道炎。患者的主要症状为尿频、尿急、尿痛等，所以患者会感觉小便完后刺痛。针对尿道炎主要是进行药物治疗，淋菌性尿道炎可以使用喹诺酮类、头孢菌素类、青霉素类药物。非淋菌性尿道炎可以使用喹诺酮类、大环内酯类、四环素类抗生素治疗。治疗期间注意个人卫生、避免性行为、多喝水、保持饮食清淡。
尿道结石与尿液中成分异常有关，也可能是因为上尿路结石移动到尿道引起的。饮食以及生活习惯不良、长期处在高温环境中都可以诱发尿道结石。患者的典型症状为排尿疼痛、排尿困难等。所以会感觉小便后刺痛。尿道结石以手术治疗为主，比如手术切开取石术、腔内碎石术、体外冲击碎石术等。此外还建议患者多喝水，有助于通过尿液冲刷尿道，帮助排石。
尿道肉阜确切病因还不明确，可能与慢性炎症刺激、不良卫生习惯、尿道梗阻、雌激素水平低下等因素有关。患者的症状为尿道口烧灼样疼痛，在排尿时可能会加重，所以感觉小便完刺痛。雌激素低下造成的尿道肉阜可以遵医嘱口服雌激素进行治疗，促进肉阜消退。此外还可以直接采取手术切除、电灼、电切等方式去除。
