果冻状大便可能是由于细菌性痢疾、阿米巴肠病、炎症性肠病、肠易激综合征、肠结核等多种原因造成的，需要进行针对性的治疗。
该病是由于志贺菌感染引起的肠道传染病，患者常见腹痛、腹泻等症状，且粪便中多伴有大量的黏液，可表现为果冻状大便。
2、阿米巴肠病
患者要注意多休息，可在医生指导下使用硝基咪唑类药物进行治疗，比如甲硝唑片、替硝唑片等，还可以配合二氯尼特片杀虫，用盐酸洛哌丁胺胶囊止泻。如果引起了肠瘘不能自愈，则要进行手术治疗切除病灶，常用的有挂线法、瘘管切开术等。
包括溃疡性结肠炎、克罗恩病，主要和肠道免疫异常有关。患者肠道黏膜受到炎症刺激可出现损伤和部分坏死现象，同时会产生大量的炎性分泌物和粪便混合，形成黏液、果冻样大便。
4、肠易激综合征
一般可使用止泻药改善腹泻症状，使用动力感觉调节剂、肠道益生菌等药物恢复肠道微生态、降低内脏敏感度。
肠结核是由于结核分枝杆菌感染肠道引起的，患者可见排便习惯改变，出现糊状、果冻状大便。
患者需要在医生指导下积极使用抗结核的药物治疗，比如利福平片、异烟肼片、盐酸乙胺丁醇胶囊等，腹泻严重者还要配合蒙脱石散、补液盐等进行缓解。如果肠道有明显的坏死、穿孔症状，可行修补术、切除吻合术等方法处理。
