阴囊上长了一个痘痘摸到疼可能是毛囊炎、尖锐湿疣、精索静脉曲张等因素引起，需要根据病因处理，具体如下：
1、毛囊炎
患者阴囊部位皮肤因为遭受损伤、摩擦刺激等因素，使细菌、真菌等病原体进入皮肤内部感染毛囊出现炎症反应时，可使局部出现疼痛、肿胀以及丘疹等症状，表现为阴囊上长了一个痘痘、摸到疼。
患者可以在医生指导下局部涂抹莫匹罗星软膏、红霉素软膏等药物治疗，能够减轻症状，还应注意皮肤清洁卫生，尽量穿宽松衣裤。
2、尖锐湿疣
患者因为感染人乳头瘤病毒诱发尖锐湿疣时可在阴囊部位出现一个疣体，类似痘痘状，少部分患者可伴随触痛、瘙痒等症状。
患者可以使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物涂抹治疗;也可以选择激光、电凝、冷冻等物理方式治疗。患病期间不可同房，以免造成交叉感染。
3、精索静脉曲张
患者精索静脉因为静脉瓣膜功能不全或者是血液回流障碍等因素，出现扩张、迂曲等情况时，可使阴囊出现一个团状类似痘痘的凸起物，触摸时可出现疼痛症状，并且伴随患侧阴囊肿大。
患者可使用七叶皂苷钠、布洛芬等药物治疗，有助于缓解不适症状。若存在不育、精液质量异常等现象，可以考虑手术治疗，如腹腔镜下精索静脉高位结扎术、精索静脉介入栓塞术等。患病期间需积极避免烟、酒等不良刺激，尽量不做增加腹压的动作。
