用合格卫生的玻璃杯喝水，对身体一般没有害。但如果使用不合格、不卫生的玻璃杯喝水，则可能会对身体有伤害。
玻璃杯在烧制过程中，并不含有机的化学物质，因此在使用时不会释放有害物质到水中。同时，玻璃杯的表面光滑，易于清洗，细菌和污垢不容易在杯壁滋生，细菌感染的风险相对较低。因此与塑料杯、金属杯相比较，玻璃杯的安全性相对较高，在使用合格卫生的玻璃杯喝水时，一般不会对身体造成伤害。
但如果玻璃杯的质量不达标，在烧制过程中混入铅或较多的颜料，长期使用可能会对人体健康造成影响，引起恶心、呕吐、腹胀、贫血等。此外，如果玻璃杯被污染或未经过充分的清洗和消毒，也可能会滋生细菌，从而引发肠道不适。因此，在使用不合格或不卫生的玻璃杯喝水，则会影响身体健康。
此外，由于玻璃杯的导热性较强，在倒入热水时没有注意控制温度，可能会导致烫伤。同时，如果玻璃杯的质量较差或存在裂痕等缺陷，也可能会在高温下发生爆裂的情况。如果在水中加入茶叶，茶叶中的鞣酸可能会与玻璃杯中的硅酸盐发生反应，生成不溶性的沉淀物，长期饮用也可能会对身体造成一定的负担。
因此，在选择玻璃杯时，建议选择质量合格、品质较好的玻璃杯。在使用前充分清洗和消毒玻璃杯，确保杯子的卫生和安全。在使用时注意控制温度，避免倒入过烫的水，以免玻璃杯爆裂。避免在玻璃杯中加入过多的茶叶、咖啡等易与杯子发生化学反应的物质。还要定期检查玻璃杯是否存在裂痕等缺陷，及时更换损坏的杯子。
