肛门内部隐痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的因素：
1.肛裂
肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
2.内痔
肛垫的支持结构、静脉丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位，内痔一般无疼痛，当内痔或混合痔脱出嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，即可出现肛门疼痛。
3.肛管直肠周围脓肿
是肛管或直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，脓肿破溃或切开引流后常形成肛瘘，主要症状为肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安。
4.肛窦炎
肛窦炎是引起肛门部下坠感的主要原因之一，另外，肛窦与肛瓣发炎也叫肛隐窝炎，进一步可发展成肛周脓肿。
5.直肠癌
肛管直肠癌破溃感染，或肛管皮肤擦伤、直肠炎等均可导致肛门疼痛。
6.血栓性外痔
多数是由于用力排便、剧烈活动或用力咳嗽使肛门缘静脉破裂，血液外渗到结缔组织内，成为血块，在肛门部皮下生成圆形或椭圆形肿块，大小不等，位于肛管内或肛缘外。肿块初起时较软，几天后变硬，这时可以有明显的肛门部疼痛。
7.其他
肛门直肠神经官能症、阴部神经症候群、骶神经肿瘤、Buttocks区感染等也可导致肛门内部隐痛。
总之，肛门内部隐痛可能是多种肛肠疾病的症状之一，需要及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，对于长期便秘、腹泻、痔疮等肛肠疾病患者，应注意保持肛门局部清洁，避免久坐、久站，饮食上应多吃蔬菜、水果等富含膳食纤维的食物，保持大便通畅。
