黑绿色大便可能与生理性因素有关，通常不需要特殊处理；也可能与急性胃炎、肠道菌群失调症、胃溃疡等疾病因素有关，根据病因可采取一般治疗、药物治疗以及手术治疗等。
如果食用了较多动物内脏、血制品，因这类食物中含有较多的铁元素，在经过消化系统时会被氧化为硫酸铁，从而导致大便呈黑绿色；其次，服用硫酸亚铁、胶体果胶铋、药用炭等药物后，因药物的特殊性质，也可导致大便呈黑绿色。
2、急性胃炎
患者平时需规律进食，保证饮食清淡，避免饮酒，并停用对胃黏膜损伤的药物，以免加重对胃黏膜的刺激。其次，可遵医嘱服用硫糖铝、米索前列醇、胶体果胶铋等胃黏膜保护剂治疗，以促进胃黏膜的修复，减轻出血。出血量较大的患者，可在胃镜下行止血治疗，必要时进行外科手术治疗。
肠道菌群失调可影响食物的正常消化，导致食物在肠道内长时间发酵，以至于生成较多的酸性物质，当其和胆红素发生反应后可形成胆绿素，从而导致大便呈黑绿色。
4、胃溃疡
患者平时需养成健康的饮食习惯，尽量以清淡易消化的食物为主，以避免溃疡进一步发展。其次，患者可遵医嘱服用泮托拉唑、铝碳酸镁、硫糖铝等药物，促进溃疡面的愈合；合并幽门螺杆菌感染者，还需配合奥美拉唑、兰索拉唑、甲硝唑、克拉霉素、阿莫西林、复方铝酸铋、胶体果胶铋等药物进行抗幽门螺杆菌治疗。对于大量或反复出血，且经药物治疗无效时，可进行内镜下止血治疗。
