肚子咕噜噜一般是指肠鸣音，晚上宝宝出现肠鸣音可能是由生理性因素导致的，也可能是由肠痉挛、胃肠炎、肠梗阻等病理性因素导致的。
肠鸣音是由肠道蠕动导致的，是肠内空气、水液等内容物与肠壁摩擦产生的声响，饥饿时会出现肠鸣音，所以晚上宝宝出现肠鸣音可能是由饥饿引起的。
肠痉挛病因尚不明确，可分为原发性肠痉挛和继发性肠痉挛，原发性肠痉挛可能是由牛乳过敏导致的，继发性肠痉挛可能是由腹腔内器质性病变导致的，包括梅克尔憩室、肠回转不良、肠套叠、肠重复畸形等，上呼吸道感染、局部受凉、暴饮暴食、进食冷饭、糖类摄入过多等情况，也会引起肠道滞气、消化不良等情况出现，诱发肠痉挛。肠痉挛发作时会引起肠鸣音亢进的情况出现，所以晚上宝宝出现肠鸣音可能是由肠痉挛引起的。
胃肠炎可分为感染性胃肠炎和非感染性胃肠炎，感染性胃肠炎是由细菌、真菌、病毒、寄生虫等病原微生物入侵机体引起的，非感染性胃肠炎可能是由应激、药物副作用、食物过敏、放射线照射、自身免疫病等情况损伤胃肠黏膜引起炎症反应导致的，喂养不当、年龄较小、经济状况较差等情况也可能诱导宝宝发作胃肠炎，胃肠炎会使宝宝出现腹泻、腹痛、反酸、呕吐、肠鸣音亢进等症状。
肠道内容物需要通过肠蠕动排出体外，肠套叠、疝、腹腔内脓肿、肠扭转、粪便干结嵌顿、肠腔异物等情况，会导致宝宝出现肠梗阻，肠梗阻使宝宝肠道内容物不能正常通行，宝宝肠道内出现积气、积水等情况，会导致宝宝出现肠鸣音亢进的情况，并伴有腹部阵发性绞痛、便秘、呕吐、腹胀等症状。
