后半夜胃疼可能与十二指肠溃疡、胃黏膜脱垂症、反流性胃炎等疾病有关。
十二指肠溃疡是常见的一种胃病，其基本原因有胃酸分泌增多、幽门螺杆菌感染、遗传等，其次，长期喝酒抽烟、精神紧张、无规律进食、感染性疾病等也可诱发十二指肠溃疡，其表现为空腹时钝痛、胀痛灼痛等，发病缓慢，多为周期性发作，发作时间可谓数周或数月，节律性，在饥饿的时候会出现疼痛，且夜间疼痛较为明显，因夜间进食量较少，一旦感到饥饿便会出现疼痛，大多表现为胃部灼痛、钝痛，在进食后症状可得到缓解，有时可伴随反酸、烧心、上腹胀、上腹不适、食欲减退、嗳气、体重减轻、便秘、腹泻、贫血等症状出现。
胃部受幽门螺旋杆菌感染、胃黏膜出现炎症水肿、幽门功能失调时，可引发胃粘膜脱垂症，其原因为胃粘膜炎症、胃蠕动过强，其次，精神紧张、烟酒、饮用咖啡等也可诱发胃黏膜脱垂症，其表现为上腹部有明显的不适感、疼痛感，晚上睡觉时疼痛会随体位的改变而改变，如右侧卧位疼痛非常明显，左侧卧位时症状会有所减轻。
反流性胃炎病因较复杂，其基本病因有胃肠道手术、患有胆囊炎或者胆结石、幽门螺旋杆菌感染等，而吸烟、酗酒、缺乏运动、暴饮暴食、高脂饮食、睡前加餐、饮用浓茶、咖啡等也可诱发或加重反流性胃炎，其典型症状表现为夜间上腹痛、腹胀、恶心、呕吐等，有时可伴有嗳气、反酸、食欲减退呕血、黑便、头晕、心悸、失眠等症状。
