半夜醒来头痛可能与环境因素、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征、颈椎病、高血压等因素有关，具体如下：
1、环境因素
若睡觉环境过度密闭，空气内氧气含量较少，引起缺氧，从而可造成头痛；或者是由于房间内存在某些刺激性气体，比如煤气泄漏导致一氧化碳释放，空气中一氧化碳含量过高时，经呼吸道吸入后与体内血红蛋白结合，使血红蛋白携氧能力和作用丧失，从而可引起缺氧表现，轻者容易出现头痛症状，重者会出现意识障碍、昏迷等症状。
2、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征
多种因素造成上气道狭窄，如鼻息肉、扁桃体肥大、肥胖脂肪堆积等，或维持开放功能的能力下降，导致气道部分或全部塌陷，从而造成夜间睡觉通气不足，体内的二氧化碳潴留过多，便会引起颅内血管扩张，从而出现半夜醒来头痛的症状。
3、颈椎病
若患者本身患有颈椎病，尤其疾病本身是由于椎间盘退行性变和椎体骨质增生性病变所致，容易压迫颈椎脊髓、神经根或椎动脉，导致交感神经刺激，从而引起一系列不适症状。如果这类患者夜间睡觉姿势不正确，或者睡觉枕头抬过高，容易导致椎动脉和交感神经受压加重，使得大脑供血不足，从而引起半夜醒来头痛的症状。
4、高血压
若患者本身存在高血压，由于白天活动量过大，或者情绪过度兴奋、紧张，或者患者本身夜间睡觉质量比较差等，导致夜间交感神经兴奋度增高，释放过多的去甲肾上腺素等神经递质，导致心率加快，心肌收缩力增强，从而导致血容量增多，进而引起半夜血压升高的现象。血压升高后，脑血流量增加，突破了脑血流的调节，使得颅内压急剧升高，进而造成患者半夜头痛的症状，部分患者还可伴有喷射性呕吐。
除了上述因素，偏头痛、心力衰竭等疾病均可能会引起半夜醒来头痛的症状。如果症状反复发作，且较为严重，建议及时就医，查明原因。
