阴道横隔可以通过体格检查、影像学检查、阴道窥镜检查等检查发现。
若视诊发现阴道较短或仅见盲端，横隔中部可见小孔并且肛诊时能触及子宫颈及子宫体，可以初步判断存在阴道横隔。
通常采取B超、核磁共振成像等观察女性生殖系统及盆腔结构和功能是否出现异常，从而进一步判断有无阴道横隔。
主要使用阴道窥镜对阴道进行检查，明确横隔上有无小孔，对于有空隙的患者还需用探针了解上方阴道的宽度及深度，有助于后期治疗方案的确定。
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