阿米卡星和头孢曲松钠都是常用的抗生素，但它们的抗菌谱、作用机制、适用情况及不良反应等方面有所不同，因此不能简单地评判哪个更好，而需要根据患者的具体病情来选择合适的药物。
阿米卡星属于氨基糖苷类抗生素，它主要通过抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用。其抗菌谱较广，对多种革兰阴性杆菌，如大肠埃希菌、克雷伯菌属、肠杆菌属、变形杆菌属等具有较强的抗菌活性，尤其对一些对其他氨基糖苷类耐药的菌株也有较好的效果。但阿米卡星有一定的肾毒性和耳毒性，使用过程中需要密切监测肾功能和听力。
头孢曲松钠是第三代头孢菌素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成来杀菌。其对革兰阴性杆菌产生的广谱β-内酰胺酶高度稳定，因此对大多数革兰阴性杆菌，包括流感嗜血杆菌、淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟菌等有强大的抗菌作用，对革兰阳性菌也有一定的抗菌活性。头孢曲松钠一般耐受性较好，不良反应相对较少，但可能会引起肠道菌群失调、过敏反应等。
在临床应用中，如果是革兰阴性杆菌感染，且患者肾功能正常，没有听力方面的问题，阿米卡星和头孢曲松钠都可能是合适的选择。但如果感染的细菌对头孢曲松钠敏感，且患者存在肾功能不全或对氨基糖苷类药物过敏等情况，头孢曲松钠会是更优先的选择。而对于一些严重的、可能存在多种耐药菌的感染，有时可能会考虑联合使用阿米卡星和头孢曲松钠，以增强抗菌效果。
阿米卡星和头孢曲松钠各有其特点和适用范围，医生会根据患者的具体病情、病原菌的种类及药敏结果、患者的身体状况等综合因素来权衡利弊，选择最适合的抗生素进行治疗。
