器官移植受者肺部感染的原因包括伤口污染、抵抗力下降、滥用抗生素等。
在进行器官移植的过程中，器械消毒不彻底、手术室达不到无菌标准、术后伤口污染等，均会导致机体感染多种病原体，当侵入肺组织后，便会引起肺部感染。
器官移植本身对患者身体的创伤较大，并且术后需要长期使用抗排斥反应的药物治疗，容易导致患者免疫力下降，促使多种病原体侵入肺部，进而引发肺部感染。
器官移植后通常会常规使用抗生素预防感染，若滥用抗生素，容易引起病原体耐药，也会增加肺部感染的风险。
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