定植菌是指各种微生物(细菌)由不同的环境中落到宿主，在一定部位定居、生长、繁殖后代，常被称为“细菌定植”。
定植菌具有粘附力，能够牢固地粘附在宿主的黏膜上皮细胞，一般不会被人体分泌物及器官蠕动所清除，其必须依靠宿主不断供给营养物质，才可以生长、繁殖。有部分定植菌因粘附不牢固，会被上皮细胞代谢到体外。
多数定植菌对于人体并无危害，但是也有部分定植菌在条件合适的情况下，可以转化为条件致病菌，容易感染机体，引起发烧、腹泻、腹痛等相关不适症状，需要使用抗菌药物进行治疗。
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