抗原和抗体可以从性质与功能、来源、结构、识别对象、存在时间与数量等方面看出区别。
1.性质与功能
抗原是能够引起免疫反应的物质，具有免疫原性和反应原性，能激活免疫系统并引发免疫应答；而抗体则是机体在抗原刺激下产生的能与相应抗原特异性结合的免疫球蛋白，主要作用是识别和结合抗原，形成免疫复合物，从而清除体内的有害物质。
2.来源
抗原可以来自外界环境，如细菌、病毒等微生物，也可以是自身的异常细胞或蛋白质；抗体则由免疫系统中的浆细胞合成和分泌，是免疫应答的产物。
3.结构
抗原的结构复杂多样，可以是蛋白质、多糖、脂类等大分子物质，也可以是小分子化合物；抗体则具有独特的结构，包括两条重链和两条轻链，形成可变区和恒定区，能够特异性地识别并结合抗原。
4.识别对象
抗原具有多种表位，可以被多种不同的抗体识别；而抗体具有特异性，通常只能识别特定的抗原表位。
5.存在时间与数量
抗原在引发免疫反应后，可能持续存在于体内，也可能被清除；抗体在初次免疫应答后逐渐产生，在体内存在的时间长短不一，有的是短期存在，有的会形成记忆细胞，再次遇到相同抗原时迅速产生大量抗体。同时，自然界中存在无数种类的抗原，而抗体的种类虽然也很多，但相对于抗原的种类来说是有限的。
